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Table 1 Silencer and replicator activity of mutated ARSs

From: Directional telomeric silencing and lack of canonical B1 elements in two silencer Autonomously Replicating Sequences in S. cerevisiae

  

Silencer activity (FOA-resistance assay)

Replicator activity (mini-chromosome stability assay)

FOAR

 

STD

Loss/generation

 

STD

 

no ARS

31%

(n = 9)

6%

n/a

  

ARS305

ACS…ATGTTTAT TTT CCCTTTAA

66%

(n = 9)

2%

3%

(n = 9)

0%

 

ACS…ATGTTTAT TTc aCCTTTAA

69%

(n = 9)

8%

4%

(n = 9)

1%

 

ACS…ATGTTTAT ccT CCCTTTAA

46%

(n = 9)

7%

30%

(n = 9)

6%

 

ACS…ATGTTTcc TTT CCCTTTAA

38%

(n = 9)

16%

30%

(n = 9)

9%

 

ACS…ATGTccAT TTT CCCTTTAA

69%

(n = 9)

7%

2%

(n = 9)

0%

ARS605

ACS…AGGAAACT TTA CAAAGCGT

64%

(n = 6)

11%

4%

(n = 6)

1%

 

ACS…AGGAAACT TTA acAAGCGT

53%

(n = 6)

4%

19%

(n = 6)

2%

 

ACS…AGGAAACT Tcc CAAAGCGT

35%

(n = 6)

12%

40%

(n = 6)

5%

 

ACS…AGGAAACc cTA CAAAGCGT

56%

(n = 6)

8%

19%

(n = 6)

2%

 

ACS…AGGAAcaT TTA CAAAGCGT

64%

(n = 6)

20%

9%

(n = 6)

6%

ARS319

ACS…TAGTGGTG ATT TTTCTGTA

64%

(n = 12)

13%

6%

(n = 9)

2%

 

ACS…TAGTttTG ATT TTTCTGTA

66%

(n = 12)

17%

3%

(n = 9)

0%

 

ACS…TAGTGGct ATT TTTCTGTA

70%

(n = 12)

11%

2%

(n = 9)

1%

 

ACS…TAGTGGTG ggT TTTCTGTA

63%

(n = 12)

12%

4%

(n = 9)

1%

 

ACS…TAGTGGTG ATg gTTCTGTA

69%

(n = 12)

14%

8%

(n = 9)

3%

 

ACS…TAGTGGTG ATT TggCTGTA

65%

(n = 12)

7%

3%

(n = 9)

2%

ARS317

ACS…ATTGCGAT TTA AAAAATCA

69%

(n = 9)

16%

3%

(n = 9)

3%

 

ACS…ATTGCGAT TTA ccAAATCA

68%

(n = 9)

12%

4%

(n = 9)

0%

 

ACS…ATTGCGAT Tcc AAAAATCA

73%

(n = 9)

17%

3%

(n = 9)

1%

 

ACS…ATTGCGAc cTA AAAAATCA

75%

(n = 9)

15%

2%

(n = 9)

1%

 

ACS…ATTGCacT TTA AAAAATCA

70%

(n = 9)

5%

2%

(n = 9)

1%

 

ACS…ATTaaGAT TTA AAAAATCA

71%

(n = 9)

5%

3%

(n = 9)

1%